152 摘要 在深海冷泉和热液喷口处生活着高密度的无脊椎动 物。这些动物带有可以为它们提供能量和营养的共生 细菌。深海双壳类动物是基于化能合成生态系统中最 重要的无脊椎动物之一。该项研究旨在揭示深海双壳 类动物中的神秘共生关系，并着重于诠释建立和维持 这种共生关系的基因组控制机制。邱教授团队建议结 合第二、三代测序技术和染色体构象捕获方法，对从 南海冷泉中收集到的双壳类Archarx sp.，Archivesica marissinica及其共生菌的基因组进行测序。他们将分 析这些基因组，重点回答：底物是如何转移到共生体 上的，以及宿主免疫系统是如何进行改变以适应共生 体的。总体而言，对双壳纲系统发育树两端两个宿主 的基因组及其共生体进行测序，将使我们能够深入了 解深海共生的起源和进化。 研究活動和進展 • 组装并分析了双壳类A. marissinica及其内共生硫 氧化细菌的基因组，并发表一篇论文于Molecular Biology and Evolution； • 分析了深海帽贝Bathyacmaea nipponica的种群连 通性及遗传分化，并发表一篇论文于Molecular Biology and Evolution； • 完成双壳类Archarx sp.及其内共生硫氧化细菌的基 因组组装，并准备开展后续分析； • 成功从双壳类Archivesica spp.的壳体中提取DNA， 并送至公司进行高通量测序。 主要發現 • 我们揭示了双壳类A. marissinica与其鳃内共生的硫 氧化细菌之间紧密的代谢互补性及独特的协同进化 特征有利于A. marissinica存活于深海化能合成生态 系统； • 我们揭示了在栖息地、地形，与洋流的交互作用 下，深海帽贝B. nipponica在西北太平洋的迁徙规 律、分化历史，以及当代基因流。 研究成果 发表文章 13 培养人才 11 新闻报道 3 詮釋兩種深海雙殼類動物共生的基因組基礎 邱建文教授 香港浸会大学 图 2. 深海帽贝B. nipponica于西北太平洋的(A)群体分布及(B-D) 种群分化。
RkJQdWJsaXNoZXIy NDk5Njg=