162 摘要 十足目甲壳类动物在各种测深海生态系统中都有很高 的丰度,但我们对它们如何适应极端环境仍然知之甚 少。为了全面阐明十足类动物与及其共生微生物对深 海环境的适应性的进化机制,本项目将分析不同生态 系统中十足类动物的肠道微生物群多样性,与及宏基 因组和十足类动物宿主的基因组,并构建关键内共生 微生物类群及其宿主的进化史。基于这些分析,我们 将能够阐明与不同栖息地相关的核心微生物群落及其 功能多样性,并且解析不同的环境中十足类动物-微生 物共生关系的共同进化。 研究活動和進展 • 利用16S rRNA基因分析,测序了来自80多种超过250 个个体生活在不同环境中与及不同系统发育历史的 十足类动物肠道微生物群落; • 测定了超过15种十足类物种的肠道共生微生物宏基 因组; • 利用转录组和一般测序数据重建十足目宿主物种的 分子系统发育关系; • 收集了多种深海十足动物样本以作宏基因组和基因 组测序。 主要發現 • 系统发育研究表明主要的十足类动物群(例如螃蟹、 虾和铠甲虾)的演化史中多次入侵深海和热液喷口栖 息地; • 宿主系统发育和微生物组成的比较发现十足类动物 群都显示出不同程度的系统共生关系,在亲缘关系 接近的物种中共生关系比较显着,而在高阶分类群 相对变弱,表明微生物组成有着进化上的限制。在 十足类动物的进化中,共生细菌在功能分组比类群 更为保守。 研究成果 发表文章 1 培养人才 2 深海十足目微生物共生的演化 曾令铭教授 香港中文大学
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