76 摘要 小豆藻纲Mamiellophyceae是海洋单细胞绿藻的重要 生态类别。虽然目前我们可通过公共微生物培养物中 心获得20多个物种的250多种菌株，但是南中国海的 菌株却尚未得到充分研究。小豆藻纲在其自然环境中 被Prasinoviruses病毒感染。Prasinoviruses病毒肆虐 可能与碳输出有关，因此，研究MamiellophyceaePras inov i rus模型具有重要的生态意义。为了比较 Mami e l l a l es和Pras inov i ruses的基因组多样性， Piganeau博士与Yung博士合作，在地中海和南中国 海组织了一次史无前例的采样工作。该项目结合了 Genophy团队和Yung实验室在菌株和病毒分离、测序、 种群基因组学和环境基因组学分析方面的互补专长， 该项目将为浮游植物-病毒相互作用，比如宿主变化， 提供新见解。 研究活動和進展 • Genophy和Yung实验室之间进行知识和实验方法 交流； • 从南中国海( 14个)和地中海(25个)的样本中筛选 Prasinoviruses病毒和Mamiellophyceae； • 提出从过滤的裂解物中提取新颖元病毒组DNA的 方案； • 对南中国海的43个元病毒组进行测序； • 分析43个元病毒组的生物学信息。 主要發現 • 对43个元病毒组生物学信息的初步分析(图1)揭示 南海66个新的Prasinovi ruses病毒基因组组合， 把现有病毒基因组资源扩增了3倍； • 确定高度分支与微藻宿主间两个候选宿主的范围 变化； • 从香港沿岸水域分离出10种新型Mamiellophyceae 菌株。 研究成果 发表文章 0 培养人才 5 地中海和南海浮游植物與病毒的相互作用： 由Mamiellales藻-Prasinovirus病毒模型系統中得到的見解 Gwenaël Piganeau教授 索邦大学 图1. 基于所有Prasinoviruses病毒，相关氯病毒基因组， 以及本课题所得南海66株新病毒进行系统发育重建 (用星号表示) O. lucimarinus virus 5 3401 HMN V1 O. tauri virus 2 O. lucimarinus virus 6 O. lucimarinus virus 3 O. lucimarinus virus 2 3401 HO V1 3401 HEFG V1 3401 HC V1 37000 HJ V1 3401 HL V1 ZA HL V3 37000 HC V1 37000 HI V1 3401 HAB V2 37000 HAB V2 O. lucimarinus virus 4 O. lucimarinus virus 1 O. lucimarinus virus 7 3401 HAB V1 ZA H0 V4 ZA H0 V1 3401 HO V2 6881 HI V2 6881 HMN V1 6881 HL V1 ZA HL V1 6881 HO V1 O. tauri virus 5 O. mediterraneus virus 1 O. tauri virus 1 6881 HG V2 6881 HMN V2 6881 HO V3 6881 HI V3 4221 HE V3 4221 HJ V1 4221 HG V2 6881 HL V2 4221 HL V1 4221 HO V1 827 HG V1 ZA H0 V3 827 HD V1 827 HL V1 827 HJ V1 827 HF V1 827 HMN V1 827 HC V2 827 HO V1 O. tauri virus 6 827 HAB V1 827 HMN V2 827 HAB V2 827 HL V3 M. pusilla virus SP1 M. pusilla virus PL1 Micromonas sp. RCC1109 virus 1 ZA HL V2 M. commoda virus 12T 827 HC V1 827 HG V2 4222 HMN V1 4222 HI V2 37000 HJ V2 4222 HJ V1 4222 HI V1 4222 H0 V1 4222 H0 V2 4222 HMN V2 B. parisnos virus 1 B. parisnos virus 2 B. calidus virus 1 B. calidus virus 2 3401 HO V3 4221 HO V2 4221 HJ V2 4221 HL V2 4221 HG V1 4221 HE V1 6881 HAB V1 6881 HI V1 6881 HG V1 37000 HAB V1 37000 HG V1 PbCVAR158 PbCVNY2A PbCV1 PbCVFR483 AtCV1 Tree scale: 1 Chlorella viruses O. tauri lysates Bathycoccus lysates M. commonda lysates B. calidus virus 3 O. lucimarinus lysates 37000 HC V2 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * O. tauri lysates O. lucimarinus lysates
RkJQdWJsaXNoZXIy NDk5Njg=